종근당에 따르면 소비자들의 환경을 생각하는 인식과 높아진 사회적 기준에 따라 종근당은 2018년 10월에는 환경경영시스템 국제표준(ISO14001)과 안전보건경영시스템 국제표준(ISO45001)을, 2019년 12월에는 에너지경영시스템 국제표준(ISO50001) 국제 인증을 획득했다.
나눔을 통한 사회공헌 활동에도 적극적으로 나서고 있다. 꾸준한 메세나 활동으로 지속적인 문화예술 후원을 이어가고 있다. 2011년부터 투병중인 환자와 가족들을 위해 전국 주요 병원을 직접 찾아가는 '오페라 희망이야기 콘서트'와 환아들을 위한 '키즈 오페라' 공연을 진행 중이다. 2012년 한국메세나협회의 '기업과 예술의 만남(Arts&Business)' 사업의 일환으로 대안공간 아트스페이스 휴와 함께 신진 미술작가를 지원하는 '종근당 예술지상' 프로젝트도 대표적 사회공헌 활동이다.
종근당은 이밖에 매월 전 임직원들이 본사가 위치한 서대문구, 연구소가 위치한 용인, 생산공장이 위치한 천안 지역의 복지시설과 소외계층을 정기적으로 방문하고 있으며 매년 여름철 혈액 수급난 극복에 힘을 보태기 위해 본사를 비롯한 전국 5개 사업장에서 헌혈캠페인을 전개해 헌혈증과 기부금을 한국백혈병어린이재단에 전달하고 있다. 시각장애인을 위한 점자벽보 만들기, 소아암 환아를 위한 마스크 만들기, 조건부 기소유예 처분을 받은 19세 미만 소년범을 위한 일대일 멘토링 프로그램인 '파랑 마니또' 활동도 진행 중이다.